Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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