Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CMC1Q7Z7K0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMC1Q7Z7K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMC1Q7Z7K0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMC1Q7Z7K0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMC1Q7Z7K0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMC1Q7Z7K0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMC1Q7Z7K0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMC1Q7Z7K0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms