Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YTHDF3Q7Z739 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YTHDF3Q7Z739 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YTHDF3Q7Z739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
YTHDF3Q7Z739 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms