Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5W3

BCDIN3D, Pre-miRNA 5'-monophosphate methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCDIN3DQ7Z5W3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCDIN3DQ7Z5W3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCDIN3DQ7Z5W3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCDIN3DQ7Z5W3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCDIN3DQ7Z5W3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCDIN3DQ7Z5W3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms