Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRPM1Q7Z4N2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRPM1Q7Z4N2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRPM1Q7Z4N2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TRPM1Q7Z4N2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRPM1Q7Z4N2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TRPM1Q7Z4N2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1605.7 ms