Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC11Q7Z392 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms