Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPCAT2Q7L5N7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPCAT2Q7L5N7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPCAT2Q7L5N7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LPCAT2Q7L5N7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT2Q7L5N7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms