Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZD4Q76G19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD4Q76G19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD4Q76G19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms