Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2R2Q712K3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE2R2Q712K3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2R2Q712K3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms