Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C9orf139Q6ZV77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C9orf139Q6ZV77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C9orf139Q6ZV77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf139Q6ZV77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf139Q6ZV77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf139Q6ZV77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf139Q6ZV77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms