Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47EQ6ZV65 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47EQ6ZV65 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms