Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND5BQ6ZUT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND5BQ6ZUT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DENND5BQ6ZUT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND5BQ6ZUT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND5BQ6ZUT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND5BQ6ZUT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND5BQ6ZUT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms