Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFLNAQ6ZTI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFLNAQ6ZTI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFLNAQ6ZTI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFLNAQ6ZTI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFLNAQ6ZTI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms