Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM43Q6ZSC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM43Q6ZSC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM43Q6ZSC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms