Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR1Q6ZS17 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR1Q6ZS17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR1Q6ZS17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPOR1Q6ZS17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms