Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY4Q6ZNE9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUFY4Q6ZNE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUFY4Q6ZNE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms