Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASC2Q6XLA1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms