Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DPPA3Q6W0C5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DPPA3Q6W0C5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DPPA3Q6W0C5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DPPA3Q6W0C5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DPPA3Q6W0C5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms