Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRAIDQ6UW56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRAIDQ6UW56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms