Protein–RNA interactions for Protein: Q6T423

SLC22A25, Solute carrier family 22 member 25, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A25Q6T423 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A25Q6T423 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A25Q6T423 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A25Q6T423 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A25Q6T423 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms