Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SAMD1Q6SPF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SAMD1Q6SPF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SAMD1Q6SPF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SAMD1Q6SPF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms