Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATAD2Q6PL18 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATAD2Q6PL18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATAD2Q6PL18 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATAD2Q6PL18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATAD2Q6PL18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATAD2Q6PL18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms