Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAT1Q6PJG6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAT1Q6PJG6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRAT1Q6PJG6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAT1Q6PJG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAT1Q6PJG6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms