Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD3Q6PCD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD3Q6PCD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD3Q6PCD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFWD3Q6PCD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms