Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM71Q6P5X7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM71Q6P5X7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM71Q6P5X7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM71Q6P5X7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM71Q6P5X7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM71Q6P5X7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM71Q6P5X7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM71Q6P5X7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms