Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIST2H2AA3Q6FI13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIST2H2AA3Q6FI13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIST2H2AA3Q6FI13 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIST2H2AA3Q6FI13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms