Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL2Q6F5E8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL2Q6F5E8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CARMIL2Q6F5E8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CARMIL2Q6F5E8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms