Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REP15Q6BDI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REP15Q6BDI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REP15Q6BDI9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms