Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUPD1Q68J44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUPD1Q68J44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUPD1Q68J44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUPD1Q68J44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms