Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L1Q676U5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG16L1Q676U5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG16L1Q676U5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms