Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf57Q5W0N0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf57Q5W0N0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf57Q5W0N0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf57Q5W0N0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf57Q5W0N0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms