Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM46CQ5VWP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM46CQ5VWP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM46CQ5VWP2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM46CQ5VWP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM46CQ5VWP2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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