Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM27D1Q5T7N8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM27D1Q5T7N8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM27D1Q5T7N8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM27D1Q5T7N8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms