Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HP1BP3Q5SSJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HP1BP3Q5SSJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms