Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATAT1Q5SQI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATAT1Q5SQI0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATAT1Q5SQI0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATAT1Q5SQI0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATAT1Q5SQI0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms