Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO47Q5MNV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO47Q5MNV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO47Q5MNV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO47Q5MNV8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms