Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB41Q5JT25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB41Q5JT25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB41Q5JT25 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB41Q5JT25 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms