Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.57■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
XKR4Q5GH76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XKR4Q5GH76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XKR4Q5GH76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XKR4Q5GH76 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XKR4Q5GH76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms