Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NOM1Q5C9Z4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NOM1Q5C9Z4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NOM1Q5C9Z4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOM1Q5C9Z4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOM1Q5C9Z4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOM1Q5C9Z4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms