Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf46Q504U0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C4orf46Q504U0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4orf46Q504U0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms