Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GREB1Q4ZG55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GREB1Q4ZG55 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GREB1Q4ZG55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms