Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF212Q495C1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNF212Q495C1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF212Q495C1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms