Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF260Q3ZCT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF260Q3ZCT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF260Q3ZCT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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