Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL9Q3SXZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTLL9Q3SXZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL9Q3SXZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL9Q3SXZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms