Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP27-1Q3LI81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP27-1Q3LI81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP27-1Q3LI81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms