Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-BQ31612 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-BQ31612 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-BQ31612 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms