Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6LQ2NKX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6LQ2NKX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC6LQ2NKX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC6LQ2NKX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms