Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT24Q2M2I5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KRT24Q2M2I5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT24Q2M2I5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KRT24Q2M2I5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms