Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms