Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN3Q16667 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN3Q16667 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN3Q16667 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN3Q16667 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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